肺真菌病需要与以下几种疾病相鉴别：
1. 细菌性肺炎：细菌性肺炎的临床表现和肺真菌病非常相似，易于混淆。经过规范的抗生素治疗后病情没有改善时，应考虑肺真菌感染的可能。
2. 其他病原体如病毒、支原体、衣原体、军团菌等所致的肺炎：有时也类似肺真菌感染，须注意鉴别。及时进行病原学检查有助于早期诊断。
3. 肺结核：慢性坏死性肺曲霉病患者可有低热、盗汗、消瘦等症状，病情迁延，病灶内形成空洞，与肺结核相似。鉴别主要依靠病原学检查。
4. 非感染性肺部疾病：隐源性机化性肺炎也常有“晕轮征与反晕轮征”，可类似于侵袭性肺曲霉感染。心源性肺水肿时可出现两肺弥漫性磨玻璃影，类似于肺孢子菌肺炎。需要结合患者的基础疾病、免疫状态、临床表现、实验室检查和病原学检查综合判断。
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擅长疾病：呼吸系统急危重症疾病的抢救及有创或无创机械通气治疗、睡眠呼吸障碍、慢阻肺、肺心病、呼吸衰竭及咯血的救治。
擅长疾病：呼吸内科常见病和危重病的诊治及呼吸机、呼吸内窥镜、肺功能的应用。
擅长疾病：呼吸系统疾病的诊治，尤其是慢性气道疾病、肺间质病、肺部感染性疾病、肺癌等，能熟练使用电子支气管镜进行诊治，应用无创呼吸机抢救呼吸衰竭患者。
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擅长疾病：复杂重症肺部感染，呼吸疑难病症、慢性阻塞性肺病、支气管哮喘、肺癌、间质性肺病、肺血管病，尤其擅长呼吸内镜诊断及介入治疗、内科胸腔镜等技术。
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