主要易与可导致心包积液的一些疾病相混淆，如：急性化脓性心包炎、结核性心包炎和心包恶性肿瘤等。急性化脓性心包炎除表现心包积液的症状外，还表现高热、心前区疼痛，发病早期在心前区可听到心包摩擦音等全身中毒症状。心包积液则表现为脓性分泌物，患者对抗炎治疗效果明显。结核性心包炎表现为低热、盗汗，心包积液可培养出抗酸杆菌。心包恶性肿瘤不易与心包胸腺瘤区别，如无明显的原发病灶的临床表现以资区别的话，则主要依靠术后病理检查。
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