接受免疫制剂疗法的病人采用联合用药方式，服用吗替麦考酚酯胶囊作为联合应用免疫制剂药物时，有增加淋巴瘤和其他恶性肿瘤，特别是皮肤癌发生的危险。这一危险与免疫制剂的强度和持续时间有关，而不是与某一特定的药物有关。免疫系统的过度抑制也可能对感染的易感性增加，临床试验中吗替麦考酚酯已与以下药物联合应用：抗淋巴细胞球抗体、环孢素和皮质激素类药物，以预防排斥反应和治疗难治性排斥。