成都中医药大学第二临床医学院/第二附属医院于2007年正式成立。2006年四川省卫生干部管理学院、四川生殖卫生学院并入成都中医药大学整合组建。四川省卫生干部管理学院创建于1938年的四川省立成都高级医事职业学校, 四川生殖卫生学院则由四川省计划生育研究所（1978年成立）和成都妇幼保健与计划生育专门人员培训中心（1980年成立）合并而成。
目前医院为联合国世界卫生组织人类生殖研究合作中心、联合国人口基金南南合作培训中心、四川省人口和计划生育科学研究所和四川省生殖保健服务中心，以培养临床医学和生殖医学高素质应用型医学人才为目标，致力于医学研究和服务社会。
学院以西医临床人才培养为主体，办学层次以本科为主，兼研究生教育和专科教育。开设临床医学专业及临床医学专业（全科方向），2007年开始招收临床医学专业（本科），多年来为基层医疗机构，科研、教学和妇幼保健等单位培养了大批从事临床医疗、预防保健等工作的高素质应用型医学人才；2010年取得临床医学一级学科硕士学位授予点。每年招收本专科学生400余人，招收研究生20余人，现有研究生、本专科学生和成教学生共计2400余人，其中农村定向免费临床医学本专科学生600人。
学院现有教职员工167人，其中高级职称42人，中级职称41人，初级职称68人；博士生导师2人，硕士生导师9人（含兼职导师）；其中享受国务院特殊津贴4人，四川省有突出贡献专家3人；四川省学术技术带头人3人；国家教育部重点学科带头人1人。形成了一批以专家为学术带头人，中青年骨干为主的教学、科研、临床专业人才队伍，具备较强的理论教学、科学研究和临床实践实力。
“十二五”以来(2011-2014)，学院承担了国家自然科学基金、973项目、财政部行业专项、国家卫生和计划生育委员会等各级各类科研课题91项，到位科研经费近千万；发表论文170余篇，其中SCI源刊论文12篇。学院现有国家重点学科2个建设方向和校级重点学科1个。
学院以“立德树人”为中心，重视学生综合素质的培养与提高。不断开拓进取，积极探索大学生思想政治教育的新思路，坚持“让学生明确发展方向，让学生得到发展机会，让学生增强发展动力”的素质教育理念。作为学校的大学生心理健康教育特色基地，抓理想信念、育健康人格、促健康成人、保顺利成才，真心帮助学生成长，耐心解决学生困难，热心方便学生办事，公心维护学生权益。以培养学生创新力及岗位素质需求为导向，搭建科学技术、社会实践、文化体育“三位一体”的综合素质培养平台，开展系列科技学术活动和文体艺术活动，致力于为社会培养全面发展、基础扎实、知识面宽、能力强、素质高的应用型临床医学人才。
该院毕业生就业情况：就业态势良好，专业对口率高,就业去向为各级医疗卫生单位。2013年一次性就业率97.16%，专业对口率93.37%；2014年一次性就业率95.34%，专业对口率93.5%。其中，毕业生中考上北京大学、武汉大学、四川大学、第三军医大学、中国医科大学等知名高校的研究生111名；参加四川大学华西医学院、四川省人民医院、成都陆军总医院等医院的规范化医师培养的毕业生56名；到成都军区、中国人民解放军武警部队、中国人民解放军东海舰队等部队就业的毕业生27名。
第二附属医院是经四川省卫生厅批准，以中西医生殖保健、优生优育、妇幼保健为特色优势的医疗机构，是省级唯一的计划生育服务机构，2006年经卫生部批准成为开展“体外受精-胚胎移植”和“卵胞浆内单精子显微注射技术”试管婴儿技术的医疗机构。医院设有生殖医学中心、内科、中西医结合科、外科、妇科、中医科、儿科、皮肤科、医疗美容科、口腔科、麻醉科、医学检验科、医学影像科、体检科等科室，拥有一批国内外知名教授为代表的临床医学、预防保健和中西医结合专家。在男性节育技术、辅助生殖技术领域研究方面，一直处于世界先进水平。目前为“四川省中西医结合学会妇产科专委会”、“四川省性学会男性学专委会”、“成都市中医学会妇科专委会”主任委员单位。
学院积极开展国际交流与合作，负责开展计划生育及生殖医学技术国际培训工作：先后培养全国各类计划生育干部和社区医疗卫生人员20000余人。受联合国人口基金(UNFPA)、世界卫生组织(WHO)和美国自愿手术绝育协会(AVSC)等国际组织委托，举办国际培训班。
