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1996年至今,医院共获国家最高科学技术奖1项,国家自然科学二等奖1项,军队科技进步一、二、三等奖 12 项,军队医疗成果一、二、三等奖 44项,上海市科技进步一、二、三等奖 15 项,中华医学科技二等奖、三等奖各1项,上海市医学科技奖一、二、三等奖 11 项,上海市医疗成果一等奖、三等奖各1项。陈嘉庚医学奖 1 项,何梁何利基金奖 2 项。在研课题150项,资助经费13000万元。举办各类国际、全国学术会议三十余次。
1996年1月,中央军委授予吴孟超院长“模范医学专家”荣誉称号。近年来,医院有1 人入选长江学者奖励计划特聘教授,2 人入选国家“百千万”人才工程,1 人获中国有突出贡献博士,2人获全国“巾帼建功”标兵,2人获全军“育才奖”金奖,17人获全军“育才奖”银奖,2 人获总后“一代名师”、6人当选总后科技“金星”、“银星”、“新星”人才,4人获上海市“科技精英”称号,5人获上海市“银蛇奖”,1人获“上海教育功臣”荣誉称号,1人获军队专业技术重大贡献奖,8人享受政府特殊津贴。
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