百色市第二人民医院始建于1978年，是我市唯一一所集精神医疗、科研及教学于一体的国家二级精神疾病专科医院，是全市精神卫生防治技术指导与培训机构，全市城镇职工医保、城乡居民医保、低保医疗救助定点医院。2014年3月，市编委会正式下文同意百色市精神卫生中心挂靠我院，实行两块牌子一套人员管理。
医院定编病床350张，实际开放病床750张，核定人员编制数140人（含后勤控制数8人）。现实有干部职工419人，其中在职在编人员为116人，编外人员229人，退休人员74人。其中，卫生专业技术人员275人，正高级职称5人，副高级职称30人，中级职称54人，初级职称186人，管理人员8人，其他技术人员7人。
医院分为总院和城北院区两部分，主要开展的业务项目有精神疾病诊疗、心理疾病诊疗、康复理疗、神经内科疾病诊疗及精神司法鉴定等。精神疾病诊疗是我院的主要诊疗项目，精神科也是我院的主要业务科室。目前精神科设有6个病区，主要诊治各种类型的精神病、慢性酒精中毒等疾病。2016年成立医院精神分裂症、精感障碍、酒精和药物依赖和临床心理4个临床研究室。目前精神科诊疗水平和规模在西南周边地区处于领先地位。心理科是我市率先开展心理咨询与心理治疗的临床科室，具有完善的心理测定系统，可以针对不同人人群进行心理咨询、检查、治疗。心理科技术团队拥有心理治疗师1人、二级心理咨询师2人、三级心理咨询师7人。医院还依托精神专业和心理专业人才优势，成立了医院心理危机干预救援队，共有27名专业技术人员参加，承担百色市突发公共卫生事件的心理救援工作。疼痛科是我院的重点特色品牌科室，科室开展的“小针刀”特色疗法、岐黄针治疗技术、药刀靶向疗法、传统中医药疗法等特色诊疗技术，对治疗颈椎病、腰椎病、脑血管疾病后遗症、各型关节疼痛疾病和“传统中医药疗法”治疗常见神经内科疾病等，技术先进、疗效显著，深受百色及滇黔桂周边地区广大患者的好评。我院精神康复中心引进开展了经颅磁刺激治疗、生物反馈治疗系统、认知矫正治疗系统、书画、手工、阅读、家居训练、音乐疗法、社会功能训练、兴趣疗法、体能锻炼疗法等10多项精神康复服务项目，有力保障的精神疾病患者的康复训练和回归社会。
医院于2019年10月18日成立了成瘾医学中心，下辖成瘾医学门诊、酒精依赖研究室、成瘾医学住院病区，病区开设病床60张，是一个集科研、教学、诊疗、预防一体，以科研指导临床工作、用临床实践为科研提供有力支撑的专业机构，主要开展酒精中毒、酒精成瘾、酒精性脑病、其他精神活性物质（冰毒、麻古、摇头丸、K粉等）成瘾与中毒、药物成瘾（止咳水、右美沙芬、镇静催眠药等）等疾病的诊断和治疗，同时提供烟瘾咨询及治疗，开展赌博障碍（赌瘾）、游戏障碍（网瘾）等成瘾行为的咨询和治疗服务等，并为成瘾患者的共病或并发症提供一体化治疗，为全市广大成瘾患者带来了福音。我院成瘾医学中心拥有强大的医护团队，高级职称2名，副高职称8名，中级职称10名，初级职称20名，中级心理治疗师3名，三级心理咨询师2名。这也是我市首个成瘾医学研究中心、首个成瘾性疾病开放式病房。
医院睡眠医学中心于2020年7月18日成立。该中心是百色市首个标准化的集睡眠障碍预防、监测、诊断、治疗、教学和科研为一体的临床中心，主要以多导睡眠监测为核心，通过运用科学、专业的睡眠监测作为主要诊断方法，采用药物治疗、心理治疗、物理治疗和传统中医药特色疗法等综合治疗手段，为桂西地区乃至滇黔桂交界地区的睡眠障碍患者提供专业诊疗服务，解除人民大众的睡眠障碍问题。
百色市精神卫生中心司法鉴定所是自治区司法厅审核指定的司法鉴定机构。总要从事法医精神病鉴定、精神障碍医学鉴定工作，对涉及与法律有关的精神状态、法律能力进行鉴定等，也填补了我市精神司法鉴定领域的空白。
医院目前拥有螺旋CT、彩色B超、进口全自动生化分析仪、脑电地形图仪、光化学免疫分析仪、DR、血球仪、血凝仪等一批先进的仪器设备。
医院占地面积3.8万平方米，建筑面积2.8万平方米，院内绿树成荫，花团锦簇、环境怡人。医院先后获得了“自治区先进集体”、“自治区健康促进医院创建示范单位”、“百色市园林绿化先进单位”、“百色市先进基层党组织”、“百色市脱贫攻坚先进后盾单位”“百色市无偿献血先进集体”“百色市最美白衣战士先进集体”等荣誉称号。
