北京安贞医院成立于1984年4月，北京市心肺血管疾病研究所成立于1981年9月，北京市中西医结合心肺血管疾病研究所成立于2014年，前两者均由我国胸心血管外科奠基人吴英恺院士所创立，“一院两所”为一个全方位联合体。目前医院占地面积7.65万平方米，年医院收入50余亿元。现有职工4000余人，高级专业技术人员750余人，住院编制床位1,500张。设有10个临床中心、29个临床科室、12个医技科室，拥有国家重点学科1个，国家临床重点专科3个，年门急诊量270万人次，手术超过4万例，其中心内外科手术双双破万，疾病难易程度CMI值始终居于北京市医疗机构前列。多年来，医院全体职工秉承“公勤严廉”的院训，弘扬传承吴英恺院士精神，积极承担社会责任，致力于京津冀协同发展，出色完成应急医疗、支援西部地区、国际医疗援助等重要任务，国家卫计委授予安贞医院援几内亚医疗队埃博拉出血热疫情防控先进集体荣誉称号，连续多次获得首都卫生系统文明单位称号，先后培养出全国医药卫生系统先进工作者、南丁格尔奖章获得者、首都劳动奖章获得者、首都十大健康卫士等一批优秀医务工作者。
医院为首批国家心血管疾病临床医学研究中心，拥有符合国际标准（ISBER）的国家和北京市心血管疾病临床样本资源库，是首批获得器官移植诊疗科目资质的医疗机构之一，心血管内、外科手术例数名列全国综合医院第一，国内国际影响力日益增强。近年来，围绕优势学科，不断提升综合实力，承担中法急救与灾难医学合作中心、北京市妊娠合并心脏病转会诊中心任务，已形成以心血管病学为核心、多学科联合发展的综合学科群，为各类合并心脏病的患者提供优质医疗服务。 2017年度中国医院科技影响力排行榜综合影响力评价，安贞医院位列第41名，心血管病学位列第2名，心血管外科位列第3名，共有12个学科进入各学科影响力的前100名。复旦大学医院管理研究所发布2016年度中国医院排行榜，安贞医院排位第37名，心血管病排名第3，心外科排名第2，连续多年位居全国前列。
医院坚持以人才为核心竞争力，作为北京市科协首批院士专家工作站，引进12位院士为特聘专家，现有“北京学者”3人，二级教授12位、长江学者2名、海聚人才9名、政府特贴专家12名、 新世纪百千万国家级人选4名、省部级突贡专家7名、215工程领军人才5名及学科带头人9名、教育部新世纪优秀人才4名 、十百千工程“十”层次人选5名及“百”层次人选20名等，每年资助优秀青年业务骨干出国研修。医院努力实现由规模效益型向学院型医院转型，是首都医科大学第六临床医学院，现有首都医科大学17个博士后流动站、17个博士研究生培养点、25个硕士研究生培养点，首都医科大学博士研究生导师62名，硕士研究生导师135名；北京市心肺血管疾病研究所为独立硕士研究生招生单位，现有硕士研究生导师40名。国家级诊疗培训基地2个，国家临床医学研究中心1个,首批成为国家卫生计生委住院医师、全科医生规范化培训基地，现有15个专科基地，部级重点实验室1个，部级工程中心1个，北京市重点实验室4个，北京市工程中心2个。连年举办长城五洲国际心血管病会议，搭建良好学术交流平台。
新的时期，全院职工将继续秉承“公勤严廉”的院训，团结奋斗，努力朝着建设“三个一”，即建设“一家以治疗心肺血管为特色的大型三级甲等综合性医院；一个国家级的区域医疗中心；一个国家心血管疾病医学中心”的总目标迈进。
