哈尔滨医科大学附属第二医院创建于1954年，是集医疗、教学、科研、预防、保健和康复为一体的大型综合性三级甲等医院。
医院占地面积50万平方米，建筑面积51万平方米，拥有1个门诊部、7个住院部及4所“院中院”—— 风湿病医院、心血管病医院、五官医院、干部保健医院。全院职工3603人，其中卫生技术人员3052名，正、副高职767人，博士生导师57人，硕士生导师294人,享受国务院特殊津贴18人，“龙江学者”2人、“国家杰出青年基金”获得者1人、“教育部新世纪优秀人才”1人；开放床位3100张，年出院病人11万余人次，年手术例数5万余人次，年门诊量超过120万余人次。医院设有44个临床科室、13个医技科室；拥有国家新药临床实验研究中心、国家药品临床研究机构、省部共建教育部心肌缺血和诊疗技术重点实验室、黑龙江省器官移植中心、产前诊断与遗传病诊断中心、血液净化中心、风湿病研究所、心血管外科研究所、黑龙江省麻醉与危重病学重点实验室、黑龙江省高校药物研究重点实验室、麻醉基础理论与应用重点实验室、哈尔滨医科大学血液病研究所、药学药物研究所、呼吸病研究所、生殖内分泌医学中心。医院拥有伽玛刀、X刀、3.0TMRI、64排螺旋CT、DSA、ECT等先进医疗设备。
医院坚持开展高、精、尖医疗新技术，成功地完成心脏移植、肺移植、肝脏移植、脾脏移植、肾脏移植、睾丸移植、心肺联合移植、胰肾联合移植、甲状腺-甲状旁腺-胸腺联合移植、角膜移植、骨髓移植等移植工作，使医院在器官移植种类、技术和质量等方面都居国内领先地位。“换心人”杨玉民术后生存18年半，创造了心脏移植术后生命质量最好、生存时间最长的亚洲记录。心脏移植课题组在2002年荣获国家科技进步二等奖。肝脏移植病人也已健康存活14年。2006年成功完成全主动脉置换手术，成为国内能够开展此项技术的两家医院之一。医院以“病员至上，细心医护”为院训，重视医德医风建设，开展“以病人为中心”的整体护理工作，满足、方便了不同层次患者的医疗、保健、康复需求。2001年4月，哈尔滨医科大学护理学院在医院成立，同年5月，医院护理部李秋洁主任荣获“第38届国际南丁格尔奖”。获卫生部“2010年优质护理服务考核优秀医院”。
作为哈尔滨医科大学临床医学院，医院拥有二级学科博士点19个、三级学科博士点32个，临床医学博士后科研流动站和临床药学博士后科研工作站各1个, 卫生部专科医师培训基地31个；拥有国家临床重点专科4个、国家重点（培育）学科1个、省级重点学科11个、省特聘教授岗位学科8个；获国家级精品课程4门、国家级特色专业2个、国家级教学成果2项；承担博士生、硕士生、七年制、本科生等多层次、多轨道临床教学任务。医院拥有5200平方米独立的教学大楼，有多媒体教室、语音教室、网络教室。医院投巨资创建临床模拟教学中心，购买模拟教学模型，培训标准化病人，广泛应用于临床教学，于2009年获批建设国家级临床实验教学示范中心。医院拥有1.4万平方米本、专科学生公寓，1.6万平方米的研究生公寓。
医院重视科研工作，近年来获各级、各类课题共1060项，其中国家杰出基金1项、国家自然科学基金86项；获各级科技成果奖200项，其中国家级成果奖1项，省部级成果奖104项。在各类期刊学会上发表学术论文7924篇，被SCI收录331篇；积极开展对外交流与协作，与美国匹兹堡大学、迈阿密大学、加拿大多伦多大学等26所大学与医学院有着广泛的联系，并开展了多项科研合作，10年来仅在美国匹兹堡大学培训医务人员已达100余人次。美国匹兹堡大学、迈阿密大学已成为医院国外培训的重要基地。
几年来，医院加强了内、外环境的改造。2008年新门诊大楼投入使用。2011年新建科教楼、干部病房楼、综合病房楼总计17万平方米将全部投入使用。实现了病房“宾馆化”、庭院“花园化”，为病人营造了一个温馨、舒适的就医环境。
一流的技术、一流的服务赢得了社会广泛赞誉。医院重视三下乡工作，义诊足迹遍布黑龙江省各个市县，2010年医院购置国内首辆“汽车医院”，将三下乡工作开展到社区、村镇。医院曾多次荣获国务院、国家劳动人事部、卫生部、省政府嘉奖；先后荣获“全国百佳医院”、“全国卫生系统先进集体”、“全国卫生系统行业作风建设先进集体”、“全国绿化四百佳单位”、国家十四部委授予“全国科技、文化、卫生‘三下乡’先进集体”、“全国五一劳动奖状”等光荣称号。
今天的哈医大二院已成为学科齐全、设备先进、技术精湛、环境优美的现代化医院和临床医学院。展望未来，我们将坚持“质量建院、创新立院、人才强院、科教兴院”的建院方针，坚持“以病人为中心，提高医疗服务质量，打造专科品牌特色，提升综合实力，保证医院可持续发展”的办院方向，为早日实现国内一流、国际有影响的医院而努力奋斗。
