传染源：
肺鼠疫(pneumonic plague)是一种存在于啮齿类与跳蚤的一种人畜共通传染病，并藉跳蚤传染给各种动物及人类。它是由鼠疫杆菌(Yeresinia pestis) 所致的烈性传染病。鼠类特别是褐家鼠，是人间鼠疫的主要传染源。其他如猫、羊、兔、骆驼、狼、狐等也可能成为传染源。
(一)经鼠类等啮齿动物传播
(二)经鼠蚤传播
通过蚤为媒介，构成啮齿动物→蚤→人"的传播方式是主要传播途径。蚤类吸入含病菌的鼠血后，其中的鼠疫耶尔森菌在其前胃内大量繁殖，形成菌栓堵塞消化道，当在叮咬其他鼠或人时，吸入的血受阻反流，病菌亦随之侵入构成感染。蚤粪亦含病菌，可因搔痒通过皮肤伤口侵入人体。
(三)经皮肤传播
剥食患病啮齿类动物的皮、肉或直接接触病人的脓血或痰，经皮肤伤口而感染。
(四)呼吸道飞沫传播
肺鼠疫病人痰中的鼠疫耶尔森菌可借飞沫构成人→人之间的传播，并可引起人间的大流行。
致病菌：
肺鼠疫的致病菌为鼠疫杆菌，属肠杆菌科的耶尔森菌，为革兰阴性小杆菌，无鞭毛，无芽孢，有荚膜，兼性需氧，鼠疫杆菌含有多种抗原，与致病性和免疫性有关的有F1，T，V 3种：
1.F1抗原病菌的荚膜抗原，为一种糖蛋白，有高度特异性，已广泛用于血清等诊断。
2.T抗原中的鼠毒素，仅对鼠类有毒性，而细胞壁内的脂多糖内毒素则可引起人体热，播散性血管内凝血，补体激活和组织病变。
3.V和W抗原由质粒介导，仅存在于毒型菌株，保护病菌能在单核巨噬细胞内繁殖。
鼠疫杆菌对外界抵抗力弱，特别对热和干燥敏感，日晒和常用消毒剂均可杀灭，耐寒冷，在脓液，痰和土壤可存活1年以上。
(二)发病机制
通常肺鼠疫是由最初腺鼠疫晚期感染的继发性血行传播引起的。原发性肺鼠疫是由吸入烟雾状传染性飞沫造成的，并可在没有跳蚤或动物卷入的情况下在人与人之间传播。未经治疗的肺鼠疫具有极高的病死率。
鼠疫杆菌经淋巴管至淋巴结，引起原发性出血性坏死性淋巴结炎，病菌释放毒素可引起全身毒血症状，病菌可进入血液循环，并在其内大量繁殖引起败血症，可有感染性休克，播散性血管内凝血。病菌从呼吸道侵入则引起原发性肺鼠疫，出血性支气管炎和坏死性肺炎，出血坏死性肺门淋巴结炎和纤维素性出血性胸膜炎。
