洋葱假单胞菌肺炎有3类临床表现:①长期无症状带菌。②数月内进行性恶化,反复高热,体重进行性减轻,反复住院。③急剧致命的病情恶化,短期内死亡。女性病人临床症状常较男性严重且预后更差。典型的临床过程为严重细菌感染,表现为反复或持续的高热,进行性消瘦,肺功能急剧下降,常合并其他严重疾病(如恶性肿瘤、囊性纤维化)。少数病人可能有菌血症。洋葱假单胞菌性肺炎患者肺功能下降比铜绿假单胞菌性肺炎严重。
在免疫功能严重受损和(或)囊性纤维化病人,反复或持续高热,进行性体重减轻,肺功能急剧下降,胸部X线表现为肺实质浸润,痰培养连续2次以上阳性(培养基上仅有或主要为洋葱假单胞菌),即可诊断为洋葱假单胞菌肺炎。支气管肺泡灌洗液培养阳性亦有助于诊断。